Por padrão, o aplicativo não oferece a função de proteçãoo. Porém existem apps gratuitos que cumprem o prometido em poucos passos. No Android, por exemplo, é recomendável usar o Bloquear Whats Messenger (http://zip.net/bprhVx). No Windows Phone, utilize o WaLock (http://zip.net/bqrh1m).
Já no iPhone, as únicas opções disponíveis são pagas e os apps não possuem recomendações positivas dos usuários.
Confira o tutorial abaixo para trancar seu WhatsApp no Android (4.4.2) e no Windows Phone (8.0) com a ajuda de aplicativos gratuitos. O procedimento é similar em outras versões dos sistemas operacionais.